Будет создана сеть передовых школ — не менее 12, по одной в каждом федеральном округе страны. Детей в таких школах планируют обучать по индивидуальным образовательным программам: ученики сами смогут выбирать предметы для углубленного изучения. Этот подход ориентирован прежде всего на индивидуальную подготовку и применение новых знаний на практике.
Первые три флагманские школы планируют открыть 1 сентября 2027 года в Новгородской, Псковской и Рязанской областях. В них смогут учиться 600, 800 и 800 детей соответственно. Строительство флагманских школ запланировано также в Белгородской, Нижегородской, Омской, Челябинской областях, Карачаево-Черкесской Республике, Хабаровском крае и др. Для обучения в них одаренных ребят со всей страны будут отбирать со всей страны на конкурсной основе. Учителей также будут принимать по результатам конкурса на федеральном уровне.